Er is in Nederland een omvangrijke kennisinfrastructuur op het gebied van hiv en aids; ook op het gebied van andere soa wordt de laatste jaren meer en meer onderzoek verricht. Allerlei instituten zijn betrokken bij onderzoek. Een belangrijke rol spelen de universiteiten, GGD-en, het RIVM/CIb, de Stichting HIV Monitoring en de Amsterdamse Cohort Studies.
Het Aids Fonds stimuleert door het uitgeven van subsidies in belangrijke mate het onderzoek dat in Nederland plaatsvindt. Prioriteiten op onderzoeksgebied staan weergegeven in het Aids Fonds document Subsidiekader Vernieuwingsprojecten 2009-2010.
Onder de noemer Academische Werkplaatsen Openbare Gezondheid zijn enkel jaren geleden een aantal samenwerkingsverbanden tussen GGD-en en universiteiten gestart. Dit wordt mogelijk gemaakt door ZonMw. Een aantal werkplaatsen hebben hiv- en soa-onderzoek als speerpunt.
